醫院排放污水的主要部門和設施有:診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照相洗印、動物房、同位素治療診斷、手術室等;另外,還有食堂、家屬宿舍等排放的生活污水。
醫院污水的主要污染物其一是病原性微生物;其二是有毒、有害的物理化學污染物,包括常規的用COD、BOD5表示的有機污染物:其三是放射性污染物。